30 сентября 2006 года исполнился ровно год с момента завершения реорганизации ФГУАП «Пулково» и начала автономной работы аэропорта «Пулково».
После разделения имущество ФГУП «Аэропорт «Пулково» составили аэровокзальные комплексы "«Пулково-1» и «Пулково-2» и система взлетно-посадочных полос с рулежными дорожками и перронами. В штат сотрудников аэропорта, насчитывающий около 4200 человек, помимо служб, обеспечивающих функционирование аэропортового комплекса, вошли служба управления воздушным движением и комплекс авиационной безопасности.
У авиакомпании «Пулково» остались в собственности парк воздушных судов, авиационно-техническая база, цех бортпитания, недвижимость в виде административного здания и профилактория для летного состава. До 29 октября текущего года будет завершен процесс объединения авиакомпании «Пулково» с ГТК «Россия». Это означает, что брэнд «Пулково» останется за аэропортом вместе с почти 75-летней историей с момента появления в Петербурге «воздушных ворот».
За время самостоятельной работы аэропортом завершен ряд проектов, направленных на улучшение его инфраструктуры и повышение качества сервиса для пассажиров.
1 февраля открыт многоэтажный паркинг на 365 мест на территории «Пулково-2». В июне завершена реконструкция взлетно-посадочной полосы N2 с примыкающими рулежными дорожками, заменой светосигнального оборудования и радиотехнических объектов и ее сертификация по III категории ИКАО. Организовано автобусное сообщение между «Пулково-1», «Пулково-2» и центром города. Планируется реконструкция взлетно-посадочной полосы № 1.
В настоящее время приоритетной задачей для «Пулково» является создание плана развития на срок до 2025 года. Согласно утвержденной городским правительством «Программе развития Санкт-Петербурга как туристического центра с 2005 по 2010 годы», количество иностранных туристов увеличится на 40% по сравнению с сегодняшним уровнем и составит 5 млн чел. В планы города входит развитие на базе «Пулково» «хаба» — крупного авиатранспортного узла.
Итоги деятельности аэропорта за первую половину 2006 года демонстрируют его развитие. Сегодня полеты в Петербург на регулярных рейсах осуществляют 58 авиакомпаний. Это на 5 больше, чем в 2005 году. Общий пассажирообмен аэропорта за шесть месяцев 2006 года составил 2 173 000 пассажиров, что на 12% больше, чем за аналогичный период 2005 года.